近日，农学院智慧农业系任天恒课题组在利用小麦穗发芽抗性qtl研究的工作中取得新进展。该研究以抗穗发芽品种川农17和易感穗发芽品种川农11创制的ril群体为研究材料，通过小麦55k芯片绘制了一张含有8329个snp分子标记的高密度遗传连锁图谱。通过多年的穗上发芽率调查，在小麦3d染色体上定位了一个能够显著提高小麦整穗发芽率（the spike germination rate, sgr）的稳定主效qtl位点cqsgr.sau.3d，该位点可以解释群体中33.25%的sgr的表性变异。
图1不同株系的穗发芽情况
研究发现，凡是携带有该qtl位点的株系，其sgr值在不同的年份中分别为26.21%，21.92%，38.28%和28.95%（平均数），而不含该qtl位点的株系，其sgr值在不同年份中则分别为7.9%，4.68%，15.05%和9.26%（平均数）。两者之间具有显著差异（p<0.001）。
图2携带有相应qtl位点的株系会显著提高sgr
值得注意的是，一般来说，小麦的穗发芽率（sgr）和发芽指数（gi），发芽率（gr），发芽势（gp）等呈显著正相关关系。而在本研究中发现的主效qtl位点cqsgr.sau.3d仅显著影响sgr的表型，而与gi、gr、gp等性状之间无显著关系，因此具有更为重要的应用意义。
图3 qtl cqsgr.sau.3d对sgr和gi的影响
该研究以四川农业大学为第一署名单位，农学院李治老师和2022届硕士毕业生陈永艳为共同第一作者，任天恒副教授为通讯作者，以题目《identification of a stable major‑effect quantitative trait locus for pre‑harvest sprouting in common wheat (triticum aestivuml.) via high‑density snp‑based genotyping》在国际著名期刊《theoretical and applied genetics》（中科院一区top期刊，if=5.574）发表，为雨养农业区的小麦抗穗发芽育种提供了新依据。
全文链接：
